Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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