Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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