Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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CDSNQ15517 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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CDSNQ15517 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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CDSNQ15517 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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CDSNQ15517 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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CDSNQ15517 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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