Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 VAX1-201ENST00000277905 4494 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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PMS2P11Q13670 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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PMS2P11Q13670 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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PMS2P11Q13670 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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