Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms