Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms