Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CLDN15P56746 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CLDN15P56746 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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CLDN15P56746 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CLDN15P56746 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CLDN15P56746 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CLDN15P56746 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CLDN15P56746 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CLDN15P56746 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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CLDN15P56746 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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CLDN15P56746 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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CLDN15P56746 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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