Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms