Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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LMAN1P49257 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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LMAN1P49257 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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