Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms