Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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