Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJB6O95452 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJB6O95452 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB6O95452 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJB6O95452 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms