Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms