Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GINS2Q9Y248 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GINS2Q9Y248 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GINS2Q9Y248 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GINS2Q9Y248 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms