Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.58■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.53■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC9Q9UKV0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms