Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHORDC1Q9UHD1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms