Protein–RNA interactions for Protein: Q9P217

ZSWIM5, Zinc finger SWIM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM5Q9P217 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ZSWIM5Q9P217 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZSWIM5Q9P217 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ZSWIM5Q9P217 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ZSWIM5Q9P217 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ZSWIM5Q9P217 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZSWIM5Q9P217 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZSWIM5Q9P217 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZSWIM5Q9P217 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ZSWIM5Q9P217 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZSWIM5Q9P217 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZSWIM5Q9P217 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZSWIM5Q9P217 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZSWIM5Q9P217 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZSWIM5Q9P217 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZSWIM5Q9P217 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZSWIM5Q9P217 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZSWIM5Q9P217 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZSWIM5Q9P217 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZSWIM5Q9P217 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZSWIM5Q9P217 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZSWIM5Q9P217 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZSWIM5Q9P217 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZSWIM5Q9P217 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ZSWIM5Q9P217 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZSWIM5Q9P217 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZSWIM5Q9P217 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZSWIM5Q9P217 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZSWIM5Q9P217 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZSWIM5Q9P217 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZSWIM5Q9P217 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZSWIM5Q9P217 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZSWIM5Q9P217 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZSWIM5Q9P217 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZSWIM5Q9P217 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.8 ms