Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C2orf42Q9NWW7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms