Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM8Q9NQV8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms