Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH1

PDF, Peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDFQ9HBH1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDFQ9HBH1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms