Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW5

TIPIN, TIMELESS-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIPINQ9BVW5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TIPINQ9BVW5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TIPINQ9BVW5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TIPINQ9BVW5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TIPINQ9BVW5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TIPINQ9BVW5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TIPINQ9BVW5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TIPINQ9BVW5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TIPINQ9BVW5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TIPINQ9BVW5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TIPINQ9BVW5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TIPINQ9BVW5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TIPINQ9BVW5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TIPINQ9BVW5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIPINQ9BVW5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms