Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
EYA3Q99504 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
EYA3Q99504 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms