Protein–RNA interactions for Protein: Q96TC7

RMDN3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN3Q96TC7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
RMDN3Q96TC7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RMDN3Q96TC7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms