Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ABCC12Q96J65 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ABCC12Q96J65 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms