Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP3Q96DZ5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP3Q96DZ5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP3Q96DZ5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP3Q96DZ5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP3Q96DZ5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP3Q96DZ5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP3Q96DZ5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP3Q96DZ5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP3Q96DZ5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP3Q96DZ5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP3Q96DZ5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP3Q96DZ5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP3Q96DZ5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP3Q96DZ5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP3Q96DZ5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP3Q96DZ5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP3Q96DZ5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP3Q96DZ5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP3Q96DZ5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP3Q96DZ5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP3Q96DZ5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP3Q96DZ5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP3Q96DZ5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP3Q96DZ5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP3Q96DZ5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP3Q96DZ5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP3Q96DZ5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP3Q96DZ5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP3Q96DZ5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP3Q96DZ5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP3Q96DZ5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLIP3Q96DZ5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLIP3Q96DZ5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIP3Q96DZ5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms