Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RUNDC1Q96C34 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
RUNDC1Q96C34 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RUNDC1Q96C34 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RUNDC1Q96C34 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RUNDC1Q96C34 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RUNDC1Q96C34 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
RUNDC1Q96C34 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
RUNDC1Q96C34 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
RUNDC1Q96C34 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
RUNDC1Q96C34 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RUNDC1Q96C34 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RUNDC1Q96C34 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RUNDC1Q96C34 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RUNDC1Q96C34 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RUNDC1Q96C34 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RUNDC1Q96C34 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RUNDC1Q96C34 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RUNDC1Q96C34 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RUNDC1Q96C34 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms