Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR1

Rab4b, Ras-related protein Rab-4B, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4bQ91ZR1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rab4bQ91ZR1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab4bQ91ZR1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms