Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
GIPC3Q8TF64 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms