Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX29Q8TEQ0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms