Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI7

TMC2, Transmembrane channel-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC2Q8TDI7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMC2Q8TDI7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC2Q8TDI7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms