Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAB2

KBTBD3, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KBTBD3Q8NAB2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KBTBD3Q8NAB2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KBTBD3Q8NAB2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KBTBD3Q8NAB2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KBTBD3Q8NAB2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KBTBD3Q8NAB2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KBTBD3Q8NAB2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KBTBD3Q8NAB2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KBTBD3Q8NAB2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KBTBD3Q8NAB2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KBTBD3Q8NAB2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KBTBD3Q8NAB2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
KBTBD3Q8NAB2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
KBTBD3Q8NAB2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KBTBD3Q8NAB2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KBTBD3Q8NAB2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KBTBD3Q8NAB2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KBTBD3Q8NAB2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KBTBD3Q8NAB2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KBTBD3Q8NAB2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KBTBD3Q8NAB2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KBTBD3Q8NAB2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KBTBD3Q8NAB2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KBTBD3Q8NAB2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KBTBD3Q8NAB2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KBTBD3Q8NAB2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KBTBD3Q8NAB2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KBTBD3Q8NAB2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KBTBD3Q8NAB2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KBTBD3Q8NAB2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KBTBD3Q8NAB2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
KBTBD3Q8NAB2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KBTBD3Q8NAB2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KBTBD3Q8NAB2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KBTBD3Q8NAB2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KBTBD3Q8NAB2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KBTBD3Q8NAB2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KBTBD3Q8NAB2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KBTBD3Q8NAB2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KBTBD3Q8NAB2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KBTBD3Q8NAB2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KBTBD3Q8NAB2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KBTBD3Q8NAB2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KBTBD3Q8NAB2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KBTBD3Q8NAB2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KBTBD3Q8NAB2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KBTBD3Q8NAB2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KBTBD3Q8NAB2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KBTBD3Q8NAB2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
KBTBD3Q8NAB2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KBTBD3Q8NAB2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KBTBD3Q8NAB2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms