Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C8

LILRA3, Leukocyte immunoglobulin-like receptor subfamily A member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LILRA3Q8N6C8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LILRA3Q8N6C8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LILRA3Q8N6C8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LILRA3Q8N6C8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LILRA3Q8N6C8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LILRA3Q8N6C8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LILRA3Q8N6C8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LILRA3Q8N6C8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LILRA3Q8N6C8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LILRA3Q8N6C8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LILRA3Q8N6C8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LILRA3Q8N6C8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LILRA3Q8N6C8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LILRA3Q8N6C8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LILRA3Q8N6C8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LILRA3Q8N6C8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LILRA3Q8N6C8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LILRA3Q8N6C8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LILRA3Q8N6C8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LILRA3Q8N6C8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LILRA3Q8N6C8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LILRA3Q8N6C8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LILRA3Q8N6C8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LILRA3Q8N6C8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LILRA3Q8N6C8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LILRA3Q8N6C8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LILRA3Q8N6C8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LILRA3Q8N6C8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms