Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
FGD6Q6ZV73 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
FGD6Q6ZV73 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
FGD6Q6ZV73 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
FGD6Q6ZV73 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
FGD6Q6ZV73 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
FGD6Q6ZV73 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
FGD6Q6ZV73 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC35■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
FGD6Q6ZV73 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC34.92■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
FGD6Q6ZV73 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
FGD6Q6ZV73 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
FGD6Q6ZV73 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms