Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
VSTM1Q6UX27 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms