Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWM7

LCTL, Lactase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCTLQ6UWM7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LCTLQ6UWM7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCTLQ6UWM7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms