Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TTC41PQ6P2S7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms