Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Soga3Q6NZL0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Soga3Q6NZL0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms