Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NANOGP8Q6NSW7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms