Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYM1

C9orf131, Uncharacterized protein C9orf131, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf131Q5VYM1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf131Q5VYM1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf131Q5VYM1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf131Q5VYM1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf131Q5VYM1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf131Q5VYM1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf131Q5VYM1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf131Q5VYM1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf131Q5VYM1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf131Q5VYM1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf131Q5VYM1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf131Q5VYM1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf131Q5VYM1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf131Q5VYM1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf131Q5VYM1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C9orf131Q5VYM1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C9orf131Q5VYM1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C9orf131Q5VYM1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C9orf131Q5VYM1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf131Q5VYM1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
C9orf131Q5VYM1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
C9orf131Q5VYM1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
C9orf131Q5VYM1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
C9orf131Q5VYM1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
C9orf131Q5VYM1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms