Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FRMPD3Q5JV73 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms