Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PKD2Q13563 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PKD2Q13563 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PKD2Q13563 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PKD2Q13563 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PKD2Q13563 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PKD2Q13563 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PKD2Q13563 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PKD2Q13563 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PKD2Q13563 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PKD2Q13563 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PKD2Q13563 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PKD2Q13563 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
PKD2Q13563 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
PKD2Q13563 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PKD2Q13563 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PKD2Q13563 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PKD2Q13563 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PKD2Q13563 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PKD2Q13563 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PKD2Q13563 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PKD2Q13563 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PKD2Q13563 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PKD2Q13563 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PKD2Q13563 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PKD2Q13563 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PKD2Q13563 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PKD2Q13563 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
PKD2Q13563 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
PKD2Q13563 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PKD2Q13563 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PKD2Q13563 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PKD2Q13563 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PKD2Q13563 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PKD2Q13563 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PKD2Q13563 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PKD2Q13563 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PKD2Q13563 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PKD2Q13563 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PKD2Q13563 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PKD2Q13563 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PKD2Q13563 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PKD2Q13563 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PKD2Q13563 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PKD2Q13563 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PKD2Q13563 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PKD2Q13563 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PKD2Q13563 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PKD2Q13563 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PKD2Q13563 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
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