Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
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