Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 CDC15YAR019C 2925 nt5.06□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 SIR2YDL042C 1689 nt5.05□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 DED81YHR019C 1665 nt5.05□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 GCV1YDR019C 1203 nt5.05□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 AUA1YFL010W-A 285 nt5.05□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 MNN11YJL183W 1269 nt5.05□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 UIP3YAR027W 708 nt5.05□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 ALG5YPL227C 1005 nt5.05□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 snR17bsnR17b 332 nt5.05□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 VTH1YIL173W 4650 nt5.05□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 VTH2YJL222W 4650 nt5.05□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 BRF1YGR246C 1791 nt5.04□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 GCS1YDL226C 1059 nt5.04□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 AAD4YDL243C 990 nt5.04□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 PCL6YER059W 1263 nt5.04□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.04□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.04□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.04□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.04□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.04□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.04□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.04□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.04□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.04□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.04□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 CPR6YLR216C 1116 nt5.04□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 OCA1YNL099C 717 nt5.04□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 UBC4YBR082C 447 nt5.04□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 SRB6YBR253W 366 nt5.04□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 GSM1YJL103C 1857 nt5.04□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 SEO1YAL067C 1782 nt5.04□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 ARG4YHR018C 1392 nt5.04□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 YDL109CYDL109C 1944 nt5.03□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 YDL124WYDL124W 939 nt5.03□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 YDL144CYDL144C 1071 nt5.03□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 TRM8YDL201W 861 nt5.03□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 YER133W-AYER133W-A 342 nt5.03□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 IRC7YFR055W 1023 nt5.03□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 SNT2YGL131C 4212 nt5.03□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 HXT7YDR342C 1713 nt5.03□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 HXT6YDR343C 1713 nt5.03□□□□□ -1.6
NFI1Q12216 YDR445CYDR445C 408 nt5.02□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 LYS5YGL154C 819 nt5.02□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 NIT2YJL126W 924 nt5.02□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 MRPL4YLR439W 960 nt5.02□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 YFL034WYFL034W 3222 nt5.02□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 WHI4YDL224C 1950 nt5.02□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 CRT10YOL063C 2874 nt5.02□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 RKM2YDR198C 1440 nt5.01□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 VBA2YBR293W 1425 nt5.01□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 YLR122CYLR122C 378 nt5.01□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 YML119WYML119W 1074 nt5.01□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 PIN2YOR104W 849 nt5.01□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 YPL102CYPL102C 303 nt5.01□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 GEP3YOR205C 1671 nt5.01□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 IZH3YLR023C 1632 nt5.01□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 MTF2YDL044C 1323 nt5□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 FAP1YNL023C 2898 nt5□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 QDR1YIL120W 1692 nt5□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 YCR006CYCR006C 474 nt5□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 YDL034WYDL034W 345 nt5□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 SNO4YMR322C 714 nt5□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 LST8YNL006W 912 nt5□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 ARG8YOL140W 1272 nt5□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 HSP33YOR391C 714 nt5□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 HSP32YPL280W 714 nt5□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 FDC1YDR539W 1512 nt5□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 RAD57YDR004W 1383 nt5□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 YHR045WYHR045W 1683 nt4.99□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 ALD3YMR169C 1521 nt4.99□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 ALD2YMR170C 1521 nt4.99□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 COX26YDR119W-A 201 nt4.99□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 HSX1tR(CCU)J 72 nt4.99□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 IMP2YMR035W 534 nt4.99□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 YMR085WYMR085W 1299 nt4.99□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 LEM3YNL323W 1245 nt4.99□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 RPL3YOR063W 1164 nt4.99□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 YIL092WYIL092W 1902 nt4.99□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 TDA11YHR159W 1515 nt4.98□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 SKI8YGL213C 1194 nt4.98□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 YHR214WYHR214W 612 nt4.98□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 YAR066WYAR066W 612 nt4.98□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 CUS2YNL286W 858 nt4.98□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 STE50YCL032W 1041 nt4.98□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 AVT1YJR001W 1809 nt4.97□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 TRE1YPL176C 2352 nt4.97□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 KRE6YPR159W 2163 nt4.97□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 ACT1YFL039C 1128 nt4.97□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 YLL059CYLL059C 507 nt4.97□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 RPS0BYLR048W 759 nt4.97□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 CWC25YNL245C 540 nt4.97□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 UIP4YPL186C 915 nt4.97□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 ARR3YPR201W 1215 nt4.97□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 KCC4YCL024W 3114 nt4.97□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 SKM1YOL113W 1968 nt4.96□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 MGS1YNL218W 1764 nt4.96□□□□□ -1.61
NFI1Q12216 YBR138CYBR138C 1575 nt4.96□□□□□ -1.62
NFI1Q12216 TMN2YDR107C 2019 nt4.96□□□□□ -1.62
NFI1Q12216 DAM1YGR113W 1032 nt4.96□□□□□ -1.62
NFI1Q12216 GRE3YHR104W 984 nt4.96□□□□□ -1.62
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