Protein–RNA interactions for Protein: Q08923

CTI6, Histone deacetylase complex subunit CTI6, yeastyeast

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTI6Q08923 GRS1YBR121C 2004 nt5.79□□□□□ -1.48
CTI6Q08923 RNR3YIL066C 2610 nt5.78□□□□□ -1.48
CTI6Q08923 PHO90YJL198W 2646 nt5.78□□□□□ -1.48
CTI6Q08923 COX17YLL009C 210 nt5.78□□□□□ -1.48
CTI6Q08923 YML057C-AYML057C-A 390 nt5.78□□□□□ -1.48
CTI6Q08923 MRPL24YMR193W 777 nt5.78□□□□□ -1.48
CTI6Q08923 PRE2YPR103W 864 nt5.78□□□□□ -1.48
CTI6Q08923 ATG14YBR128C 1035 nt5.78□□□□□ -1.48
CTI6Q08923 BUD7YOR299W 2241 nt5.77□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 YDL121CYDL121C 450 nt5.77□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 XPT1YJR133W 630 nt5.77□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 MTF1YMR228W 1026 nt5.77□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 ALG5YPL227C 1005 nt5.77□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 STB3YDR169C 1542 nt5.77□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 ADE3YGR204W 2841 nt5.76□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 YIR043CYIR043C 693 nt5.76□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 YNL108CYNL108C 813 nt5.76□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 NPT1YOR209C 1290 nt5.76□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 ARB1YER036C 1833 nt5.76□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 AZR1YGR224W 1842 nt5.76□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 PMT2YAL023C 2280 nt5.76□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 YJR124CYJR124C 1347 nt5.75□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 GPI18YBR004C 1302 nt5.75□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 MRS3YJL133W 945 nt5.75□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 RFU1YLR073C 603 nt5.75□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt5.75□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 PCL1YNL289W 840 nt5.75□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 HMT1YBR034C 1047 nt5.75□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 ECM23YPL021W 564 nt5.75□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 COA2YPL189C-A 207 nt5.75□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 MRI1YPR118W 1236 nt5.75□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 YBR138CYBR138C 1575 nt5.75□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 NUP1YOR098C 3231 nt5.74□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 UGA1YGR019W 1416 nt5.74□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 YHR095WYHR095W 495 nt5.74□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 RPL15BYMR121C 615 nt5.74□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 SEC17YBL050W 879 nt5.74□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 SAP30YMR263W 606 nt5.74□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 SFT2YBL102W 648 nt5.74□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 RGS2YOR107W 930 nt5.74□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 TIP41YPR040W 1071 nt5.74□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 RAD57YDR004W 1383 nt5.74□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 SET5YHR207C 1581 nt5.73□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 ARP1YHR129C 1155 nt5.73□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 ISU2YOR226C 471 nt5.73□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 SPN1YPR133C 1233 nt5.73□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 UMP1YBR173C 447 nt5.73□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 UBP9YER098W 2265 nt5.73□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 NOP58YOR310C 1536 nt5.73□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 MMR1YLR190W 1476 nt5.72□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 FUM1YPL262W 1467 nt5.72□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 ARF2YDL137W 546 nt5.72□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 YKE4YIL023C 1041 nt5.72□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 MRPL20YKR085C 588 nt5.72□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 POP3YNL282W 588 nt5.72□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 YOL079WYOL079W 399 nt5.72□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 WHI4YDL224C 1950 nt5.72□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 DUG1YFR044C 1446 nt5.72□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 HOS1YPR068C 1413 nt5.72□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 MAG2YLR427W 2013 nt5.72□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 GMC1YDR506C 1827 nt5.71□□□□□ -1.49
CTI6Q08923 CRZ1YNL027W 2037 nt5.71□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 BRE2YLR015W 1518 nt5.71□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 RAM1YDL090C 1296 nt5.71□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 RML2YEL050C 1182 nt5.71□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 SRN2YLR119W 642 nt5.71□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 HES1YOR237W 1305 nt5.71□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 YCR006CYCR006C 474 nt5.7□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 PML1YLR016C 615 nt5.7□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 RBA50YDR527W 1320 nt5.7□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 ARH1YDR376W 1482 nt5.7□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 PUS1YPL212C 1635 nt5.7□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 PCS60YBR222C 1632 nt5.7□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 ELP2YGR200C 2367 nt5.7□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 YNL181WYNL181W 1224 nt5.69□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 DCS2YOR173W 1062 nt5.69□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 COX11YPL132W 903 nt5.69□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 ICY2YPL250C 411 nt5.69□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 YJL206CYJL206C 2277 nt5.69□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 RSC6YCR052W 1452 nt5.69□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 GDB1YPR184W 4611 nt5.69□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 YPL245WYPL245W 1365 nt5.68□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.68□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 TYW3YGL050W 822 nt5.68□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 GTO1YGR154C 1071 nt5.68□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 YHR214WYHR214W 612 nt5.68□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 SPC42YKL042W 1092 nt5.68□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 YAR066WYAR066W 612 nt5.68□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 NMD4YLR363C 657 nt5.68□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 ETT1YOR051C 1239 nt5.68□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 YPL278CYPL278C 303 nt5.68□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 YPR071WYPR071W 636 nt5.68□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 LYP1YNL268W 1836 nt5.68□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 PAL1YDR348C 1500 nt5.68□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 MET7YOR241W 1647 nt5.67□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 YMR102CYMR102C 2505 nt5.67□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 AIR2YDL175C 1035 nt5.67□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 RRP1YDR087C 837 nt5.67□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt5.67□□□□□ -1.5
CTI6Q08923 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.9 ms