Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms