Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRG1Q02297 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRG1Q02297 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRG1Q02297 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRG1Q02297 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRG1Q02297 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NRG1Q02297 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRG1Q02297 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRG1Q02297 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRG1Q02297 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRG1Q02297 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRG1Q02297 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms