Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFRSF17Q02223 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 259.9 ms