Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BEX3Q00994 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms