Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
IRX3P78415 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
IRX3P78415 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
IRX3P78415 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
IRX3P78415 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
IRX3P78415 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRX3P78415 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRX3P78415 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRX3P78415 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRX3P78415 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRX3P78415 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRX3P78415 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRX3P78415 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRX3P78415 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRX3P78415 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRX3P78415 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IRX3P78415 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IRX3P78415 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IRX3P78415 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IRX3P78415 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IRX3P78415 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IRX3P78415 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IRX3P78415 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IRX3P78415 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IRX3P78415 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IRX3P78415 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IRX3P78415 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IRX3P78415 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IRX3P78415 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IRX3P78415 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IRX3P78415 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
IRX3P78415 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IRX3P78415 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IRX3P78415 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IRX3P78415 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IRX3P78415 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IRX3P78415 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
IRX3P78415 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IRX3P78415 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IRX3P78415 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IRX3P78415 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IRX3P78415 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IRX3P78415 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IRX3P78415 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
IRX3P78415 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IRX3P78415 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IRX3P78415 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IRX3P78415 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IRX3P78415 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
IRX3P78415 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
IRX3P78415 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IRX3P78415 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
IRX3P78415 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
IRX3P78415 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IRX3P78415 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IRX3P78415 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IRX3P78415 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IRX3P78415 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IRX3P78415 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IRX3P78415 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
IRX3P78415 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IRX3P78415 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IRX3P78415 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IRX3P78415 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IRX3P78415 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IRX3P78415 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IRX3P78415 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IRX3P78415 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IRX3P78415 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IRX3P78415 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IRX3P78415 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IRX3P78415 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
IRX3P78415 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IRX3P78415 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
IRX3P78415 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
IRX3P78415 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IRX3P78415 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
IRX3P78415 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IRX3P78415 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRX3P78415 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRX3P78415 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRX3P78415 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRX3P78415 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRX3P78415 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRX3P78415 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRX3P78415 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX3P78415 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX3P78415 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX3P78415 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX3P78415 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX3P78415 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX3P78415 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX3P78415 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX3P78415 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX3P78415 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX3P78415 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX3P78415 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX3P78415 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX3P78415 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX3P78415 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms