Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSNK2BP67870 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CSNK2BP67870 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms